“计算机辅助有机合成”这一名称目前还未见中文译法，在英文中的说法是Computer-Aided Organic Synthesis，简称CAOS，我就先这么说了。和CADD（Computer-Aided Drug Design）如出一辙，呵呵。下面的内容主要参考了这篇综述：
Todd, M. H., Computer-aided organic synthesis. Chem. Soc. Rev., 2005, 34(3), 247-266.
该文值得推荐。
全文下载链接
http://cadd.ifastnet.com/incoming/_r2005_CAOS.pdf 下面开始介绍综述中提到的软件（另外有一些文中没有的软件作了补充）：
LHASA(Logic and Heuristics Applied to Synthetic Analysis)，Harvard大学的E. J. Corey教授开发，是最早的CAOS软件，主要采用Cｏｒｅｙ教授的逆合成分析思路和方法。1967年开始，Corey教授在开发这套工具时，都没有分子输入工具，而且计算机技术还不先进，于是他们自己开发了一套程序用来输入分子式，逐渐演变程了现在的ChemDraw。超强，呵呵。1997年后转向猜测化合物毒性和代谢性质。
http://lhasa.harvard.edu/SECS (Simulation and Evaluation of Chemical Synthesis) 由W. T. Wipke教授开发，时LHASA的分支，运行程序与LHASA类似，都是图形输入，利用连接表等进行路线设计，不过可以考虑目标化合物的手性中心和双键结构，前者可以有效的考察SN2反应。而且还能识别三维结构，从而计算最低能量，最终可以考察空间位阻对反应原子的影响。
SYNGEN(Synthesis Generator) 由James B. Hendrickson博士开发。目前只有MacOS平台，就不多介绍了，可以免费下载。
http://syngen2.chem.brandeis.edu/syngen.htmlEROS (Elaboration of Reactions for Organic Synthesis) 由Gasteiger教授开发
分子中的反应位点由可断裂键定义，包括双键、三键、碳－杂原子键等，因而产生的路线较IGOR大大减少。通过物理化学理论计算反应焓生成，以此剔除合成树不可能生成的产物或者反应活性低不利于下步反应的产物。
WODCA (Workbench for the Organisation of Data for Chemical Application)
Gasteiger教授把EROS程序整合到了WODCA程序中，现在作为molecular networks公司的商业产品。
http://www2.chemie.uni-erlangen.de/software/wodca/index.htmlhttp://www.molecular-networks.de/software/wodca/index.htmlOSET（Organic Synthesis Exploration Tool）由墨西哥国立自治大学的Iván Tubert博士开发，可以免费下载源代码。
http://ivan.tubert.org/caos/links.html另外，还有一些其他的软件，如IGOR (Interactive Generation of Organic Reactions) 由Ugi教授开发， SST，CHIRON， CAMEO (Computer Assisted Mechanistic Evaluation of Organic Reactions) 。
转自: 小木虫博客
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