1. 优点：（电生理特性好）在急性分离神经元时短时使用蛋白酶的原则是清除细胞外的基质，促使细胞从基质包绕中释放的同时尽量减小细胞内在特性的损伤。 胰蛋白酶消化得到的神经元电生理活性良好，而其他蛋白酶消化的后得到的神经元电生理活性却不及胰蛋白酶消化得到的神经元，表现为易形成高阻抗吉欧姆封接，但是很难形成全细胞记录，或者形成全细胞封接后迅速崩解，即神经元细胞膜脆性增加。这与文献报道的多种高效蛋白酶，如链霉蛋白酶、锯齿肽酶、枯草杆菌蛋白酶、嗜热菌蛋白酶等酶的消化特点相一致。
2.胰酶消化的缺点
2.1 Akaike和Allen的研究表明胰蛋白酶能够特异性、不可逆的损伤各年龄段大鼠新皮层、海马等部位神经元的NMDA受体。
2.2消化后神经元的产量不及其他蛋白酶。利用其他蛋白酶消化脑片后，得到的锥体神经元主突起保留更加完整(常可见大于200μm的顶树突)，神经元相差明显，表面光滑，即形态学指标更加良好。
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