酶反应的抑制可分为因蛋白质的一般性变化所造成的非特异性抑制，及因酶的种类不同而抑制程度也显著不同的特异性抑制。非特异性抑制可由紫外线、高温、酸性或碱性、蛋白质变性剂、沉淀剂、浓盐类、蛋白酶等引起，多数为非可逆性的。特异性抑制，是由特殊试剂和酶蛋白的活性基团、辅茎、辅酶、以及反应时必需的金属离子等结合后引起的；其反应如果是可逆的，则抑制也常是可逆的。氢氰酸、一氧化碳对细胞色素氧化酶和过氧化氢酶（catalase
）等血红素酶的抑制，对一氯汞苯甲酸、碘乙酸、正一乙基马来酰胺等对SH
酶（羟基酶）的抑制，氟离子对必需Mg
的烯醇酶的抑制等都属此类。此外还有，与底物构造相似的分子发生拮抗性抑制，高浓度底物引起的底物抑制、生成物抑制、变构抑制等。特异性抑制剂的研究，对酶的作用基团的了解是重要的。另对生物体内物质变化过程的阐明以及对于代谢中间产物的蓄积分离等也都是有用的。此外，尚有各种生物物质对酶的抑制（例如：反馈抑制），这种抑制对生物体内反应的调节起着极为重要的作用，在生理上也具有重大的意义。
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