核糖核酸探针
网站地图本站论坛
高级搜索收藏本站
<

上一篇:放射性标记的探针与固定在膜上的核酸Southern杂交   下一篇:应用激酶交换反应的末端标记

当前位置:试验方案>实验基础>基础知识> 正文
  • 核糖核酸探针

  • 点击:    作者:   来源: 日期:2006-11-09    本站论坛

核糖核酸探针

1.室温下,于1.5ml无菌微量离心管内依次加入:

5μl               5×转录缓冲液

1μg               模板DNA

1.2μl             10 mmol/L rATP(终浓度为480μmol/L)

1.2μl             10 mmol/L rCTP(终浓度为480μmol/L)

1.2μl             10 mmol/L rGTP(终浓度为480μmol/L)

1μl               1 mmol/L UTP(终浓度为40μmol/L)

1μl               0.75 mol/L 二硫苏糖醇

1μl               RNase Block Ⅱ或0.5μl RNasin

5μl               α-[32P]UTP(2.5μmol/L终浓度,DEPC水加至25μl)

1μl               T3, T7或SP6 RNA聚合酶(10U)

2.37~40℃温育60min。

3.若不做凝胶纯化步骤,则:

a.       加入1μl无核糖核酸酶的脱氧核糖核酸酶并在37℃温育15min。

b.      加DEPC处理水将体积增至100μl。加100μl苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)溶液再提取一次。

c.       再加入100μl氯仿:异戊醇(24:1)溶液再提取一次。

d.      加0.5倍体积7.5mol/L乙酸铵及2倍体积乙醇,置干冰中30min。

e.       10 000×g离心至少5 min(去除上清液并用盖革计数器监控)。

f.        用100μl 1mol/L乙酸铵重悬沉淀小团,重复d~e步骤。

g.       真空(真空旋转蒸发/浓缩仪)干燥沉淀小团,用DEPC水重悬沉淀小团,取1μl置液闪仪计数。

4.若需做凝胶纯化,则:

a.       将无RQ1 RNA酶的DNA酶处理步骤省去。

b.      制备测序凝胶(5%聚丙烯酰胺/6mol/L 尿素)

c.       加DEPC水将核糖核酸探针溶液体积增加至100μl,100μl苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)溶液提取一次,100μl氯仿:异戊醇(24:1)再提取一次。

d.      加0.5倍体积7.5mol/L乙酸铵,加2倍体积乙醇置干冰30分钟。

e.       10 000×g离心至少5min(去除上清液,并用盖革计数仪监控),真空干燥,用5μl DEPC水重悬沉淀。

f.        加10μl上样缓冲液,全部的样品上样电泳(样品上样前加热到85℃ 5min即置入冰中),在60W条件下至少电泳1.5h。

g.       去除玻璃板,用塑料薄膜包裹凝胶,X射线胶片曝光30~60s,核糖核酸探针所处位置呈现自显影像,用剃须刀准确切下相应凝胶条带。

h.       凝胶条用400μl洗脱缓冲液,37℃下,连续振荡洗脱4h。洗脱液移入干净离心管,盖革计数器检测洗脱液及凝胶条块(洗脱液中计数值应高于凝胶条)。

i.         加1μl冰冷乙醇并静置冰浴15min。

j.        10 000×g离心15min,乙醇沉淀。RNA沉淀用DEPC水再溶解,取1μl置液闪仪计数。

推荐文章
 
相关文章
推荐专题
 

↑返回顶部   打印本页   关闭窗口↓  
 本站申明 联系我们 网站地图
Copyright© 试验方案

Powered by DedeCms email:htmyth#yahoo.com.cn

Optimized to 1024x768 to Firefox,Opera and MS-IE6