蛋白质双向电泳过程与体会
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蛋白质双向电泳过程与体会

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-04-09  本站论坛

100%TCA 10ml
2-ME 0.07ml
丙酮 90ml
0.07%2-ME 丙酮 (100ml):
2-ME 0.07ml
丙酮 100ml
0 Farrel 液(9.5M Urea,2%NP-40,0.4%Am3.5~10,1.6%5~7,5% 2-ME)
50ml
Urea 28.5g
NP-40 1ml
Ampholine 5~7 2.0ml
3.5~10 0.5ml
2-ME 2.5ml



注意定容!配好后用1.5ml 管分装!-70度保存
注意 这两个溶液 配的时候 比如配 50ml 用100ml的烧杯 用量筒量50ml 水 倒如烧杯里面,用记号笔标上刻度,然后把水倒掉,再称 尿素 小量加水,因为尿素加水后体积会变大,再37 度水域锅里溶,然后加其它成分,最后再定到50ml
(2002-10-30 18:39:37)
UKS液 (含9.5M Urea, 5mMK2CO3,1.25%SDS,0.5%DTT,2%Ampholine(3.5~10),6%Triton X-100)
25ml 50ml
Urea 14.25g 28.5g
K2CO3 17.25mg 34.5mg
SDS 0.3125g 0.625g
DTT 0.125g 0.25g
2-ME
Ampholine(3.5~10) 1.25ml 2.5ml
Triton X-100 1.5ml 3ml(0.86ml 2 枪,4枪)
2-ME 可适当加一些!注意定容!配好后用1.5ml管分装!-70度保存!
双向电泳IPG(summer)
一、样品提取:三氯醋酸—丙酮沉淀法
(1) 在液氮中研磨叶片
(2) 加入样品体积3倍的提取液在-20℃的条件下过夜,然后离心(4℃8000rpm以上1 小时)弃上清。
(3) 加入等体积的冰浴丙酮(含0.07%的β-巯基乙醇),摇匀后离心(4℃8000rpm以上1小时),然后
真空干燥沉淀,备用。
(4) 上样前加入裂解液,室温放置30 分钟,使蛋白充分溶于裂解液中,然后离心(15℃8000rpm以上
1小时或更长时间以没有沉淀为标准),可临时保存在4℃待用。
(5) 用Brandford法定量蛋白,然后可分装放入-80℃备用。
二、一向电泳(13cm的holder)
(1) 取大约70-100ng的蛋白与溶胀液混合总体积达到250vl
(2) 将上述溶液加到holder 的两个电极之间。
(3) 去掉胶条的保护膜,胶面朝下,先将胶条尖端朝胶条槽的尖端方向放入胶条槽中,慢慢下压胶条,
并前后移动,避免生成气泡,最后放下胶条平端,使溶液浸湿整个胶条。
(4) 在胶条上覆盖适量的覆盖油,盖上盖子。
(5) 将胶条槽平放于一向仪器上,与水平方向垂直。
(6) 设置仪器的运行参数:
三、胶条的平衡(由一向到二向)
(1) 将胶条放入10ml 平衡缓冲液中(加入10mgDTT)封口,在振荡仪上振荡15 分钟。
(2) 将胶条取出放入10ml 新的平衡缓冲液中(加入250mg 的碘乙酰胺)封口,在振荡仪上振荡15 分
钟。
(3) 用去离子水润洗胶条一秒钟,将胶条的边缘置于滤纸上几分钟,以去除多余的平衡缓冲液。
四、二向电泳
(1) 将平衡好的胶条直接转移到第二向制好的SDS胶上,然后用琼脂糖封顶,准备第二向电泳.
(2) 设置仪器的运行参数:
五、平板胶的染色
硝酸银染色:(整个操作在摇床上进行)
(1) 固定:25ml的冰醋酸,100ml甲醇,125ml 去离子水,60 分钟。
(2) 敏化:75ml甲醇,0.5g硫代硫酸钠(使用之前加入),17g醋酸钠,165ml去离子水,30分钟。
(3) 清洗:用250ml 的去离子水清洗3 次每次5 分钟。
(4) 银染:0.625g硝酸银,250去离子水,(使用之前配制)20 分钟。
(5) 显色:6.25g碳酸钠,100vl 的甲醛(使用之前加入),250ml 去离子水。
(6) 终止:5%的醋酸。
(7) 照相分析。
(8) 保存制作干胶。
药品:
提取液:含10%TCA 和0.07%的β-巯基乙醇的丙酮裂解液:2.7g 尿素0.2gCHAPS 溶于3ml 灭菌的去离子水中(终体积为5ml),使用前再加入1M 的DTT65ul/ml。
平衡缓冲液:1.5MTris-Cl ph8.8 6.7ml,尿素72.07g ,87%的甘油69ml,SDS 4g,溴酚蓝少许。溶涨液:尿素12g,CHAPS0.5g,溴酚蓝少许溶于无菌水中,总体积为25ml。使用之前再加入IPG缓冲液0.5vl/100vl,DTT1.5vl/100vl。




制作平板胶:

分离胶的配制方法:
药品/浓度 5% 7.5% 10% 12.5% 15%
丙烯酰胺 6.7ml 10ml 13.3ml 16.7ml 20ml
分离胶缓冲液 10ml 10ml 10ml 10ml 10ml
10×SDS 0.4ml 0.4ml 0.4ml 0.4ml 0.4ml
无菌水 22.7ml 19.4ml 16.1ml 12.8ml 9.5ml
10%过硫酸胺* 200vl 200vl 200vl 200vl 200vl
TEMED* 13.3vl 13.3vl 13.3vl 13.3vl 13.3vl
*在灌胶之前加入
药品配制:

丙烯酰胺单体储液:丙烯酰胺60g甲叉双丙烯酰胺1.6g溶于无菌水中总体积200ml分离胶缓冲液:Trisbase181.5g 溶于750ml 无菌水中调PH8.8总体积1000ml10%SDS:SDS5g溶于无菌水中总体积50ml10%的过硫酸胺:0.1g溶于无菌水中总体积1mlSDS 电泳缓冲液:Trisbase15.1g甘胺酸72.1gSDS5g溶于无菌水中总体积5000ml
封胶溶液:SDS电泳缓冲液100ml 琼脂糖0.5g溴酚蓝少许附:蛋白质含量测定的方法(Bradford 方法)
原理:这一方法基于2 考马斯亮蓝G-250 有红蓝两种不同的形式。在一定浓度的乙醇及酸性条件下,可配成淡红色的溶液,当与蛋白质结合后,产生蓝色化合物,反应迅速而稳定。反应化合物在465-595nm处有最大的光吸收值,化合物颜色的深浅与蛋白浓度的高低成正比关系,因此可检测595nm的光吸收值的
大小计算蛋白的含量。
溶液:
1)Bradford储存液
100ml95%乙醇
200ml88%磷酸
350mgServaG蓝
室温下长期保持稳定。
2)Bradford工作液
425ml双蒸水
15ml95%乙醇
30ml88%磷酸
30ml Bradford储存液
用滤纸过滤,保存于室温棕色瓶中,可保存数周,但在使用前需要过滤。
3)配制1mg/ml牛血清蛋白(BSA)
做标准曲线:


取样品即可测量。
注意事项:
1、样品的问题:

样品制备是做好2-d 的关键,这句话好象有点多余,如果样品中离子浓度过大,根本做不了2d,我开始的时候由于提取方法有问题,结果浪费了很多时间和IPG胶条,真的很心痛呀!另外再说明一点,最好用新鲜的样品提取蛋白质,蛋白点的差异很大,新鲜的样品点多,而我用存放在-80 的样品跑出来效果差了很多呀!如果你不确定你的蛋白提的如何,建议你先跑sds-page。检验一下。关于蛋白的提取方法,我还想听听各位的建议。

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