琼脂糖凝胶电泳技术
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琼脂糖凝胶电泳技术

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-04-09  本站论坛

1、实验目的:
学习与掌握DNA电泳的技术方法,利用琼脂糖凝胶电
泳检测DNA纯度、含量以及分子量,及分离不同大小
DNA片段。
2、实验原理:
电泳概念及种类*
• 电泳: 是指带电粒子在电场中向与其自身带相反电荷的电极移动的现象

电泳基本原理
迁移率(或泳动度)是指带电颗粒在单位电场强度下泳动的速度,可用下列公式计算:
U =υ/E =(d/t)/(V/l) =dl/Vt
U为迁移率(cm2·V-1·min-1);υ为颗粒泳动速度(cm·s-1);E 为电场强度( V·cm-1);d 为颗粒泳动的距离(cm);l为滤纸有效长度(cm);V为实际电压(V);t为通电时间(s或min)。通过测量d, l, V, t, 即可计算出被分离物质的迁移率。

1迁移率单位= 10-5 cm2·V-1·min-1在确定的条件下,某物质的迁移率为常数,是该物质的化学特征常数

颗粒带净电荷多,直径小而接近于球形,则在电场中泳动速度快,反之则泳动速度慢。

迁移率还与分子的形状,介质粘度,颗粒所带电荷有关,迁移率与颗表面电荷成正比,与介质粘度及颗粒半径成反比。

影响琼脂糖电泳迁移的主要因素*
电场强度
溶液的pH值
溶液的离子强度
电渗现象
温度的影响
支持物的影响

电泳的分类
按分离原理分类:
1.区带电泳
2.移界电泳
3.等速电泳
4.聚焦电泳
按有无固体支持物分类



影响琼脂糖电泳迁移的主要因素
DNA的大小
DNA的构象*
琼脂糖浓度*
缓冲液*

不同构像质粒

分离不同大小DNA片段的合适琼脂糖凝胶浓度

缓冲液
TAE:乙酸盐缓冲液
TBE:硼酸盐缓冲液
TPE:磷酸盐缓冲液

实验操作
1. 用胶带将洗净、干燥的水平板的边缘封住,形成一个胶模并水平放置。
2. 按水平板的长×宽×0.5cm胶厚,量取0.5×TBE,并按0.7%的浓度称取agarose琼脂糖,在微波炉或电炉上加热至全熔* (清澈透明)。
3. 等凝胶温度降至大约50-60℃以下时,加入1 mg/L溴化乙锭(EB)至终浓度为0.5ug/mL ;摇匀并轻快地倒入水平板中,除掉气泡,插入梳子*。



4. 凝固后,将梳子轻轻拔出。
5.去掉胶带,将水平板放入加有0.5×TBE电泳缓冲液的电泳槽中,并且使电泳缓冲液高出凝胶约1mm。
6.在parafilm膜上依次加:
ddH2O 6ul
上样Buffer 2ul
DNA 4ul
分别混匀后点样,记录点样次序。
7. 在水平板两边的点样孔中分别加入6 μ l的λΔΝΑ/EcoRI HindIII marker*。
8. 盖好电泳槽盖子,选择适当的电泳电压(≤5V/cm)及电泳方向(DNA阴极阳极),开始电泳。
9. 当色素接近胶的先端,停止电泳,样品在紫外灯下观察、成像。







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