NCBI资源介绍及使用手册

基因表达

CGAP cDNA表达谱 — 在UniGene簇和cDNA库中的ESTs分布。可以在CGAP页面上访问。

SAGEmap — CGAP SAGE（Serial Analysis of Gene Expression）库的差异显示。也包含了对在人类GenBank记录中的SAGE标签的完整分析，在人类GenBank记录中一个UniGene的标志被分配给了每个含有一个SAGE标签的人类序列

遗传变异

dbSNP — 单核苷酸多态性数据库，包括SNPs，小范围的插入/缺失，多态重复单元，和微卫星变异。DbSNP包含种族特异的频率和基因型数据，实验条件，分子上下文，及中性多态和临床变异的定位信息。

OMIM — 在线人类孟德尔遗传—约900个OMIM记录的等位变异。为了查看这些OMIM记录的列表，在等位变异字段上搜索“0001”。或者，把一个疾病的名字同“0001”放到一起。如：Gaucher & 0001。

位点特异突变数据库 — 从OMIM主页和相关的LocusLink条目链接到许多外部数据库。

失调

基因和疾病 — 介绍遗传因素和人类疾病的关系。有约60种遗传疾病的概要信息，以及链接到相关数据库和组织。

Mitelman癌症染色体变异摘要 — 由Drs. Mitelman, Mertens, 和 Johansson建立的基因组范围的人类癌症中染色体断裂位点图谱。参见Nature Genetics, Vol. 15(Spec. No.):417-74 (April 1997)的超文本版本。

OMIM — 在线人类孟德尔遗传—经常更新的人类基因和遗传失调的目录，有链接到其它相关的文献参考，序列记录，和相关数据库。

OMIM Morbid Map - alphabetical listing of diseases and corresponding cytogenetic map locations, with links to OMIM entries. Accessible from OMIM page (see Genes).

OMIM致病图 — 按字母排列的疾病和相应的细胞遗传图位点，链接到OMIM的条目。可以从OMIM页面访问。

癌症研究

CCAP — 癌症染色体变异计划—计划用来加速同恶性转移相关的显著染色体变异的定义和详细的特征描述。

CGAP — 癌症基因组剖析计划 — 交叉学科项目，目的是基于cDNA库，鉴定在不同癌症阶段的人类基因表达，和决定正常，癌前和恶性细胞的分子表达谱。是NCI，NCBI和其它许多实验室的合作。

Mitelman癌症染色体变异摘要 — 由Drs. Mitelman, Mertens, 和 Johansson建立的基因组范围的人类癌症中染色体断裂位点图谱。参见Nature Genetics, Vol. 15(Spec. No.):417-74 (April 1997)的超文本版本。

SAGE分析 — 在癌症库中的SAGE标签的差异表达

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍

小鼠基因组

小鼠基因组资源向导 — 把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。

小鼠基因组测序 — 小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由测序中心的数据建立，可以contig或染色体的形式来下载。

小鼠UniGene — 被整理成簇的EST和全长mRNA序列，每一个代表一种特定已知的或假设的基因，有定位图和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene目录下下载

位点链接（LocusLink） — 为校正过的序列和遗传位点的描述信息提供一个单次查询界面。LocusLink给每个位点发布一个稳定的ID，并提供官方的命名，序列accesssion number， Unigene簇，图谱信息，和相关的网址。LocusLink是NCBI，人类基因命名委员会，OMIM和其它组织的合作结果。LocusLink目前包含人类，小鼠，大鼠，斑马鱼，和果蝇的位点，物种可以被分开或合在一起查询。

Entrez —包括了来自〉70000个物种的序列数据，可以用物种字段来限制记录只在小鼠搜索。

人类/小鼠同源图 —University of California at Davis的M. F. Seldin建立，一张比较人和老鼠在同源区段DNA上基因的表，按在每个基因组上的位置排列。

大鼠基因组

大鼠UniGene —被整理成簇的EST和全长mRNA序列，每一个代表一种特定已知的或假设的基因，有定位图和表达信息以及同其它资源的交叉参考。序列数据可以以cluster形式在Unigene网页下载，完整的数据可以从FTP站点repository/UniGene目录下下载

位点链接（LocusLink） — 为校正过的序列和遗传位点的描述信息提供一个单次查询界面。LocusLink给每个位点发布一个稳定的ID，并提供官方的命名，序列accesssion number， Unigene簇，图谱信息，和相关的网址。LocusLink是NCBI，人类基因命名委员会，OMIM和其它组织的合作结果。LocusLink目前包含人类，小鼠，大鼠，斑马鱼，和果蝇的位点，物种可以被分开或合在一起查询。