PCR技术及其在植物基因克隆中的应用；功能蛋白组技术分离目的基因；基因文库技术分离目的基因；mRNA差别显示技术分离差别表达基因；图位克隆目的基因；标签法分离克隆目的基因；酵母双杂交系统分离目的基因；基因芯片技术及生物信息学技术在分离克隆目的基因中的应用。植物基因启动子的分离克隆。
第四章 目的基因的同源性和异源性表达//外源基因的瞬时表达和稳定表达；瞬时表达的应用；真核基因在植物细胞中的表达；原核基因在植物细胞中的表达；植物基因在细菌和酵母中的表达。第五章 外源基因在转基因植物细胞内的表达调控//转录调控序列对外源基因表达的影响；mRNA 3'-端非编码序列对外源基因表达的影响；5'-端内含子的影响；外源基因在转译水平表达的调控；外源基因转译后的细胞内定位及加工；外源基因的整合、重排及甲基化；外源DNA整合的遗传效应对基因表达的影响；转基因沉默的类型及其机理；克服转基因沉默的策略。反义RNA, RNAi, Knock out技术。
第六章 植物基因工程动态//抗病植物基因工程；抗虫植物基因工程；抗除草剂植物基因工程；抗逆植物基因工程；品质改良；花形花色控制；雄性不育系的创建；生物反应器。
第七章 植物基因工程展望//
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