酵母遗传学方法1:DNA分离
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酵母遗传学方法1:DNA分离

点击:   作者:   来源:  时间: 2006-11-09  本站论坛

酵母DNA分离

1)酵母DNA微量制备(40ml

1.在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量(过夜)。

2.将上述培养物移入螺盖离心管,用医用离心机或Sorvall SS-34转头以5000r/min离心5分钟,弃去上清液。

3.将细胞悬浮在3ml的0.9mol/L山梨醇-0.1mol/L Na2EDTA(pH7.5)溶液中。

4.加0.1ml的2.5mg/ml消解酶100T,置37℃条件保温1小时。

5.用医用离心机或Sorvall SS-34转头以5000r/min离心5分钟,弃去上清液。

6.将细胞重新悬浮在5ml的50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)-20mmol/L醋酸钠溶液中。

7.加0.5ml的10%十二烷基硫酸钠(SDS),混匀。

8.置65℃保温30分钟。

9.加1.5ml的5mol/L醋酸钾溶液,在冰浴上放置1小时。

10.  用Sorvall SS-34转头以1000r/min离心10分钟。

11.  将上清液转移至干净的塑料离心管中,室温下加入两倍体积的95%乙醇,混匀,以5000~6000r/min离心15分钟。

12.  弃上清液,将沉淀物干燥,然后悬浮在3ml TE缓冲液(pH7.4)中,此操作可能需要几个小时。

13.  Sorvall SS34转头以1000r/min离心15分钟,将上清液转移到一个新试管,弃沉淀物。

14.  加入150μl1mg/ml RNaseA溶液,在37℃下保温30分钟。

15.  加入一倍体积的100%异丙醇,轻轻混匀,取出呈松散纤维状的沉淀物,无需离心,让其自然干燥。

16.  将沉淀物悬浮在0.5ml TE缓冲液(pH7.4)中,置4℃保存。酵母DNA的最终浓度约为200μg/ml。如果最后的溶液混浊不清,用异丙醇再次沉淀DNA或用Sorvall SS34转头以1000r/min离心15分钟。

 

2)酵母DNA微量制备(5ml

1.按酵母于5ml YPD中,置30℃培养过夜。

2.用医用离心机以2000r/min离心5分钟沉淀细胞,弃上清液。

3.将细胞悬浮在0.5ml1mol/L山梨醇-0.1mol/L Na2EDTA(pH7.5)缓冲液中,转动一支1.5ml离心管中。

4.加入0.02ml2.5mg/ml的消解酶100T溶液,置37℃保温1小时。

5.离心1小时。

6.弃上清液,把细胞悬浮在0.5ml50mmol/L Tris-HCl(pH7.4)-20mmol/L Na2EDTA溶液。

7.0.05ml10 SDS,混匀。

8.65℃保温混合物30分钟。

9.0.2ml5mol/L醋酸钾,把离心管在冰浴中放置1小时。

10.  离心5分钟。

11.  将上清液转移到一洁净微型离心管,室温下加入等体积的无水异丙醇,混匀,放置5分钟。短暂离心(10秒钟)弃上清液,让沉淀自然干燥。

12.  0.3ml TE缓冲液(pH7.4)重新悬浮沉淀。

13.  加入15μl1mg/mlRNaseA溶液,置37℃保温30分钟。

14.  0.03ml3mol/L醋酸钠,混匀,用0.2ml的无水异丙醇沉淀,再短暂离心收集DNA

15.  弃上清液,自然干燥,用0.10.3ml TE缓冲液(pH7.4)重新悬浮DNA

16.  在使用限制性内切酶酶解DNA之前,有必要将最终浓度溶液离心较长时间(15分钟)以便除去可能抑制酶解的不溶性物质。

 

310分钟制备酵母DNA方法

大肠杆菌或酵母转化质粒的制备

1.在质粒DNA选择性培养基中,置30℃培养少量培养物过夜。

2.将培养物转入一支1.5ml的微型离心管,离心5秒,收集细胞。

3.小心倾去上清液,轻弹离心管,使沉淀重新悬浮于残余培养液中。

4.加入0.2ml2 Triton X1001SDS100mmol/L NaCl10mmol/L Tris-HCl(pH8)1mmol/L Na2EDTA;加入0.2ml的苯酚:氯仿:已戊醇(25241);加入0.3g酸洗过的玻珠。

5.振荡2分钟。

6.离心5分钟。

7.15μlDNA的水相转化0.2ml的大肠杆菌受体菌,用15μl水相转化酵母菌。

 

用于Southern分析的基因组DNA分离

1.YPD培养基,置30℃培养10ml酵母至最大生长量。

2.用医用离心机离心2分钟,弃上清液,收集细胞,用0.5ml蒸馏水重新悬浮,将细胞转入1.5ml微型离心管中,离心5秒收集细胞。

3.重复第二步。

4.重复第二步。

5.0.2ml TE缓冲液(pH8),振荡34分钟。

6.离心5分钟,将水相移至洁净试管,加1ml的无水乙醇,上下倒置,混合均匀。

7.离心2分钟,弃上清液,悬浮在0.4ml TE缓冲液和3μl10mg/mlRNase A溶液,置37℃保温5分钟,加入10μl  4mol/L醋酸铵和1ml的无水乙醇,上下倒置,混匀。

8.离心2分钟,弃上清液,自然干燥后,用50μlTE缓冲液悬浮,每份样品用10μl进行Southern印迹分析,每份用量约24μg DNA

 

4)酵母基因组DNA:玻珠制备法

1.5ml培养基在30℃下,摇床培养过夜。

2.转移培养物至13mm×100mm的玻璃离心管中,用台式离心机以1500r/min离心5分钟,收集细胞。

3.3ml无菌水洗细胞,同上离心。

4.500μl裂解缓冲液再次悬浮。

5.加入干净玻珠(约1.5ml Eppendorf离心管的2/3体积)和25μl5mol/L NaCl

6.以最高速振荡1分钟。

7.2000r/min离心2分钟。

8.P-1000移液器转移上清液至一支1.5ml的离心管。

9.加入500μl苯酚,振荡,离心1分钟。用P-1000移液器吸取水相,转移至洁净离心管,加入500μl SEVAG(氯仿:已戊醇,241),同上振荡,离心,抽提。

10.  加入1ml95%的冷冻乙醇,在-20℃下沉淀1小时。

11.  以最高转速离心沉淀DNA,弃上清液,用70%乙醇清洗,最后悬浮在250μl TE缓冲液中。

12.  25μlEDTA-Sark5μl的蛋白酶K10mg/ml),置37℃保温30分钟。

13.  250μl5mol/L醋酸铵,重复910步骤。

14.  收集DNA,用70%乙醇洗,悬浮于100μlTE缓冲液。

 
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