TAIL-PCR
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TAIL-PCR to clone flanking sequence from Feldmann

点击:   作者:51protocol收集   来源:  时间: 2007-03-29  本站论坛

查看大图 Thermo-cycling: #10 to #18, and then #19, #20, #21, #53
查看大图

查看大图 Cycling #10: 92oC; 5 min;[Add 0.2 ul Taq polymerase (Perkins-Elmer's or Stratagene's) after 4 min denaturation, link to clcling #18
查看大图 Cycling #18 (5 cycles of the following):

查看大图 94oC, 1'
查看大图 62oC, 1'
查看大图 72oC2.5'


查看大图 Cycling #19 (1 cycle of the following):

查看大图 94oC, 1'
查看大图 25oC, 3'
查看大图 Ramp to 72oC in 3'
查看大图 72oC2.5'


查看大图 Cycling #20 (15 cycles of the following):

查看大图 94oC, 30''
查看大图 68oC, 1'
查看大图 72oC, 2.5'
查看大图

查看大图 94oC, 30''
查看大图 68oC, 1'
查看大图 72oC; 2.5'
查看大图 94oC, 30''
查看大图 44oC; 1'
查看大图 72oC; 2.5'


查看大图 cycling #21:

查看大图 72oC, 5'


查看大图 Cycling #53

查看大图 4oC. soak



  • Dilute the primary reaction product with water to 1/50, then set up the 2nd reaction

    查看大图 44ul PCR stock
    查看大图 2.5ul TL-2 (50uM)
    查看大图 2.5ul AD-2 or OPA-2 (50uM)
    查看大图 1ul 1/50 diluted 1st reaction

  • Thermo-cyclings: #10 (0.2u. Taq polymerase was added after 4 min denaturation) to #22, and then #21, #53.
    Cycling #22 for 12 cycles:


    查看大图 94oC, 30''
    查看大图 64oC, 1'
    查看大图 72oC, 2.5'
    查看大图

    查看大图 94oC,30''
    查看大图 64oC, 1'
    查看大图 72oC, 2.5'
    查看大图

    查看大图 94oC, 30''
    查看大图 44oC, 1'
    查看大图 72oC, 2.5'



  • Dilute the 2nd PCR product to 1/50 with water, and carry out the tertiary reaction

    查看大图 44ul PCR stock
    查看大图 2.5ul TL-1
    查看大图 2.5ul AD-2 or OPA-2 (50uM)
    查看大图 1ul 1/50 diluted 2nd reaction product

  • Thermo-cycling: #10 (0.2ul Taq polymerase was added after 4' denaturation in #10), and then #12, #52 .
    Thermo-cycling #12 for 25 cycles:


    查看大图 94oC,1'
    查看大图 37oC, 1
    查看大图 72oC, 1'

  • 1.5% agarose electrophoresis of all three PCR reaction products.
  • Purify the PCR products using Pharmacia's Spin-Column S-300.
  • Cloning PCR product by using Stratagene's PCR polishing kit and pCRScript Amp (SK ) cloning kit or my favorite one-tube cloning method .

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