| PCR (Polymerase chain reaction) 是用一对寡聚DNA作为引物,
通过加温变性-退火-DNA合成这一周期的多次循环,使目的DNA片段得到扩增。
由于这种扩增产物是以指数形式积累的,经25-30个循环后,扩增倍数可达106。
Dr. Karry Mullis 1985年发明,获1993年度诺贝尔化学奖;
(二)基本要素 1 Taq DNA聚合酶: 水生栖热菌(thermus aquaticus,Taq)的DNA聚合酶 ①5’→3’DNA聚合酶活性; ②无3’→5’外切酶活性, 35轮0.25%错配,与原始模板有差别; 最适聚合酶 温度72℃,选择72℃延伸 半衰期:92.5℃ 130min 95℃ 40min
97.5℃5—6min 变性温度:≤95℃使其在整个扩增循环中保持足够活性
pfu DNA 聚合酶
耐热 5’→3’DNA聚合酶活性 3’→5’外切酶活性 精确度:pfu >Taq 但pfu扩增效率通常比Taq酶略差
文献报道:Taq pfu 会起到较好效果
(2)Primer 本身不要出现内部互补序列 形成loop环,内部二级结构 如: GGGTCGATTCCTACCCATGC (3)注意减少Primer间互补序列 导致2个Primer形成dimer 一般不要超过3个互补bp

(4)Primer 5’未端可修饰、突变: 修饰 如:32P、生物素、荧光素,不影响其效果
突变: AGCTCCATGACCCAG 5’CGCTCCATGACCCAG 3’
注意:绝不可以在3’端进行上述改造 ∵DNA聚合酶是5’→3’聚合,若3’端改造→不能互补→不能延伸
(5)primer 5’端增加碱基
 ②ATG起始密码 ③TAA、TAG、TGA终止密码 如: 可溶性受体的表达,无膜内区、穿膜区,只有膜外区。 3.模板: 可选:DNA mRNA→逆转录→cDNA DNA包括: 质粒 噬菌体 染色体DNA 较小 较大 ①目的gene是单拷贝 变性较易 变性较难 ②非常大,变性难 模板用量 Plasmid:lng Chromosome:300-500ng 注意: 防止交叉污染 4.dNTP: 四种脱氧核苷酸,基本原料 终浓度:50mM 注意:不稳定,保5.Mg2 TaqDNA聚合酶作用时需要Mg2 不同的酶需不同Mg2 Taq:较少,Mg2 对反应影响很大,0.5-1.5mM终浓度 pfu:Mg2 2-3mM,dNTP、primer用量约增加一倍 外界影响: EDTA鳌合Mg2 ∴选较低浓度TE(10mM Tris,1mMEDTA); DNA模板、引物和dNTP 的磷酸基团均可与Mg2 结合, 降低Mg2 有效浓度。 ∴如果扩增产物或效率不理想,要注意调整合适的 Mg2 浓度 存时间长会失效 6.温度和时间: (1)变性温度:94-95℃ Templete:GC比例高、长度很长,则变性T↑ (2)退火:温度越高,扩增特异性越好 取决于Tm值:Tm↑退火T↑; Tm↓退火T↓ 若Tm较高,可使退火和延伸在同一温度 (3)延伸: £500nt---1min >500nt--3min 一般:40-60sec (三)PCR技术的应用 1. 基因检测: 2. 基因克隆化 3. DNA突变 4. DNA序列分析
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