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PCR技术(PCR ,Polymerase chain reaction)

点击:   作者:   来源:  时间: 2007-03-07  本站论坛


PCR (Polymerase chain reaction) 是用一对寡聚DNA作为引物,

通过加温变性-退火-DNA合成这一周期的多次循环,使目的DNA片段得到扩增。

由于这种扩增产物是以指数形式积累的,经25-30个循环后,扩增倍数可达106

Dr. Karry Mullis 1985年发明,获1993年度诺贝尔化学奖;

 

(二)基本要素
1 Taq DNA聚合酶:
水生栖热菌(thermus aquaticus,Taq)的DNA聚合酶
①5’→3’DNA聚合酶活性;
②无3’→5’外切酶活性,
35轮0.25%错配,与原始模板有差别;
最适聚合酶 温度72℃,选择72℃延伸
半衰期:92.5℃ 130min
95℃ 40min


 



97.5℃5—6min
变性温度:≤95℃使其在整个扩增循环中保持足够活性

 

pfu DNA 聚合酶

耐热
5’→3’DNA聚合酶活性
3’→5’外切酶活性
精确度:pfu >Taq
但pfu扩增效率通常比Taq酶略差

文献报道:Taq pfu 会起到较好效果


(2)Primer 本身不要出现内部互补序列
形成loop环,内部二级结构
如: GGGTCGATTCCTACCCATGC
(3)注意减少Primer间互补序列
导致2个Primer形成dimer
一般不要超过3个互补bp

 


 


(4)Primer 5’未端可修饰、突变:
修饰
如:32P、生物素、荧光素,不影响其效果

突变:
AGCTCCATGACCCAG
5’CGCTCCATGACCCAG 3’

注意:绝不可以在3’端进行上述改造
∵DNA聚合酶是5’→3’聚合,若3’端改造→不能互补→不能延伸

(5)primer 5’端增加碱基


②ATG起始密码
③TAA、TAG、TGA终止密码
如: 可溶性受体的表达,无膜内区、穿膜区,只有膜外区。
3.模板:
可选:DNA
mRNA→逆转录→cDNA
DNA包括: 质粒 噬菌体 染色体DNA
较小 较大 ①目的gene是单拷贝
变性较易 变性较难 ②非常大,变性难
模板用量
Plasmid:lng
Chromosome:300-500ng
注意: 防止交叉污染
4.dNTP:
四种脱氧核苷酸,基本原料
终浓度:50mM
注意:不稳定,保5.Mg2
TaqDNA聚合酶作用时需要Mg2
不同的酶需不同Mg2
Taq:较少,Mg2 对反应影响很大,0.5-1.5mM终浓度
pfu:Mg2 2-3mM,dNTP、primer用量约增加一倍
外界影响: EDTA鳌合Mg2 ∴选较低浓度TE(10mM Tris,1mMEDTA); DNA模板、引物和dNTP 的磷酸基团均可与Mg2 结合, 降低Mg2 有效浓度。 ∴如果扩增产物或效率不理想,要注意调整合适的 Mg2 浓度 存时间长会失效
6.温度和时间:
(1)变性温度:94-95℃
Templete:GC比例高、长度很长,则变性T↑
(2)退火:温度越高,扩增特异性越好
取决于Tm值:Tm↑退火T↑;
Tm↓退火T↓
若Tm较高,可使退火和延伸在同一温度
(3)延伸:
£500nt---1min >500nt--3min
一般:40-60sec
(三)PCR技术的应用
1. 基因检测:
2. 基因克隆化
3. DNA突变
4. DNA序列分析

 

 


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