PCR操作范例及反应体系的组成
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  • 点击:    作者:   来源: 日期:1970-01-01    本站论坛

石蜡油

50100.0

 

  扩增条件:9460s,3760s,72120s,2530个循环。

  注:[1]反应缓冲液[10×]含:100mmol/l Tris-HCl pH8.3(25),

  15mmol/L KCl, 15mmol/L MgCl2,

  0.01%(W/V)明胶(Sigma G2500

  [2]酶储存缓冲液(-20℃)含:50%甘油,100mmol/l KCl,

  20mmol/L Tris-HCl ph8.0

  0.1mmol/L EDTA, 1.0mmol/L DTT

  200μg/ml明胶

  0.5%吐温200.5% Nonidet P40

  [3][4]引物,12:扩增λ-噬菌体基因中500bp的片段

  引物1序列:713171555’)-GATGAGTTCGTGTCCGTACAACTGG-(3)

  引物2序列:760676305’)-GGTTATCGAAATCAGCCACAGCGCC-(3)

  注意(3’)端有2bp互补故易生成50bp的双体

  二、PCR反应系统的组成

  (一)PCR缓冲液(PCr Buffer

  用于PCR的标准缓冲液见PCR操作范例。于72℃时,反应体系的pH值将下降1个单位,接近于7.2。二价阳离子的存在至关重要,影响PCR的特异性和产量。实验表明,Mg2 优于Mn2 ,而Ca2 无任何作用。

  1Mg2 浓度Mg2 的最佳浓度为1.5mmol/L(当各种dNTP浓度为200mmol/L),但并非对任何一种模板与引物的结合都是最佳的。首次使用靶序列和引物结合时,都要把Mg2 浓度调到最佳,其浓度变化范围为110mmol/LMg2 过量易生成非特异性扩增产物,Mg2 不足易使产量降低。


  样品中存在的较高浓度的螯合剂如EDTA或高浓度带负电荷的离子基团如磷酸根,会与Mg2 结合而降低Mg2 有效浓度。因此,用作模板的DNA应溶于10mmol/l Tris-HCl(pH7.6)0.1mmol/L EDTA中。

  dNTP含有磷酸根,其浓度变化将影响Mg2 的有效浓度。标准反应体系中4×dTNPs

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