Volume 446 Number 7133 pp231-342 (15 March 2007) March 15, 2007
封面故事:瑞典博物学家林奈诞辰300周年
2007年是瑞典博物学家林奈(Linnaeus)诞辰300周年,本期Nature也来凑这份热闹。相关文章包括对系统发育基因组学现状的分析、关于《濒危物种法案》的政治问题、以及对业余分类学家所起作用的分析与评估等。两篇评论文章(分别在第259页和261页)讨论了在数据处理方式发生了革命性变化和生命科学其他领域迅速发展的情况下继续采用林奈物种分类方法所存在的问题。Staffan Müller-Wille解释了在Systema Naturae中提出的risqué概念何以使得分类学被当成一种业余爱好而流行。事实上,林奈的著作今天仍然在影响着生物学研究,读者在本期Nature上第279页和第312页的研究论文中就能发现林奈思想的强烈影响。而且,如果你仔细看的话,也许在本期其他地方也能找到这种影响。封面图片:Jovan Djordjevic
March 15, 2007
杂交物种形成方式可能更普遍
杂交在新物种形成中的作用是一个有争议的话题。在植物中,涉及多倍体的杂交物种形成(例如染色体的复制)很常见,而在本期的一篇综述文章中,James Mallet提出的遗传学证据表明,没有多倍体的杂交物种形成要比所想的更普遍。也许令人吃惊的是,该观点除了植物外也适用于动物,包括人类在内——在人类这个分支中,杂交甚至在智人(Homo sapiens)起源之初就是一个因素。
March 15, 2007
SOCE的分子基础已基本清楚
“钙池调控钙离子进入”(SOCE)是一种普遍的信号过程,在这一过程中,内质网(ER)中Ca2+水平的降低诱发Ca2+穿过胞质膜向里流动。自Jim Putney首次于20年前描述这一过程以来,SOCE已经在几乎所有细胞中被探测到,它涉及到诸如分泌、生长控制、淋巴细胞激活和免疫等重要功能。尽管人们对SOCE非常感兴趣,但其分子基础在前不久为ER Ca2+传感器编码的基因以及“由Ca2+释放激活的Ca2+”(CRAC)通道被发现之前仍然不清楚。现在,关于CRAC通道激发过程和SOCE过程的一个分子画面正在开始出现。
March 15, 2007
中耳的演化过程
中耳的三块小骨头由爬行动物下颚构成部分的形成,是哺乳动物演化过程中的一个关键事件。以前,这一过渡从未像在一个原始哺乳动物化石中所看到的那么清楚。该化石是最近在中国义县组的一个新地点发现的,位于辽宁省的经典化石产地以西300公里。在这一标本中, 中耳骨仍然由麦氏软骨(Meckel’s cartilage)与下颚连在一起,这个过渡与下背部一次相应的重塑相关。但情况并不像表面上看起来那样明了。该化石的演化关系表明,要么“现代的”中耳独立演化过两次,要么它曾经涉及过至少一个古代分支、然后又在它们身上消失了。
March 15, 2007
SOCE的分子基础已基本清楚
“钙池调控钙离子进入”(SOCE)是一种普遍的信号过程,在这一过程中,内质网(ER)中Ca2+水平的降低诱发Ca2+穿过胞质膜向里流动。自Jim Putney首次于20年前描述这一过程以来,SOCE已经在几乎所有细胞中被探测到,它涉及到诸如分泌、生长控制、淋巴细胞激活和免疫等重要功能。尽管人们对SOCE非常感兴趣,但其分子基础在前不久为ER Ca2+传感器编码的基因以及“由Ca2+释放激活的Ca2+”(CRAC)通道被发现之前仍然不清楚。现在,关于CRAC通道激发过程和SOCE过程的一个分子画面正在开始出现。
March 15, 2007
一个由碰撞产生的“柯伊伯带天体”家族
在小行星带中,有很多单独的小行星家族,每个家族由有相似轨道的很多小行星组成,它们是一次灾难性碰撞所留下的残留物。过去,在海王星以外的遥远太阳系中一直没有探测到由碰撞产生的小行星家族。但是现在,Brown等人介绍了一个柯伊伯带天体(KBO)家族,它们的表面性质和轨道与2003 EL61的几乎相同,后者是第三大已知的KBO,大到足以拥有两个卫星。 该家族成员自形成它们的碰撞以来的历史,将为了解太阳系中巨大碰撞的后果提供新的数据。
March 15, 2007
用非吸收性原子流探测光子
在连续观测的微观量子体系中,应有可能探测到被束缚的粒子的量子态的突然变化或跃迁。科学家已经用有质量的粒子如电子和分子等做到了这一点,但对没有质量的光量子一直没有可能做到,因为标准的光探测器吸收光,使得无法对同一光子进行重复测量。现在,通过使用一个非吸收性原子流来探测存储在一个超导空穴中的微波光子,这一障碍已经被克服。高度关联在同一状态的数百个原子的次序被突然的状态切换所中断。这些电报信号记录着单个光子的出生、寿命和死亡。这个结果接近了爱因斯坦希望对单个光子进行测量和称重的梦想,而在该实验中,一个原子流充当了爱因斯坦所希望的灵敏天平。
March 15, 2007
能钻比本身尺寸小很多的光钻头
机械工具的尺寸限制了它们的空间分辨率。例如,对一个钻头来说,其直径就决定了它所能钻的(最小)孔的大小,用10-毫米钻头来钻1-毫米的孔显然是不可能的。然而,在光学世界里,这种“不可能”是能够发生的。Aeschlimann等人展示了一种基于光的工具,它不仅能够钻比其本身尺寸(由其波长决定)小很多的孔,而且能够在可以选择的位置上做到这一点,这些位置可以以光速来改变。该实验将适应性控制与纳米光学结合在一起,来控制光与物质之间的相互作用,分辨率可以达到亚波长水平,时间精度可以达到飞秒级。
March 15, 2007
震动、慢滑动与地震
持续时间较长的地震信号会在一些大断层上间歇性出现,经常伴随着非地震事件或“慢滑动”地震事件。这种震动背后的机制及其与非地震滑动的关系尚未被弄清。David Shelley等人发现,日本四国地下的震动可以解释为大量小型低频率地震,其中每次都是作为潜没带板块界面上的剪切断层作用出现的。这表明,震动和慢滑动是一个单一过程的不同显示方式。
March 15, 2007
排水草科是被子植物的近亲
排水草科(Hydatellaceae)是小型水生植物,生长在不引人注目的地方,传统上被认为是单子叶开花植物,与草本有关。现在,研究人员利用最新分子技术对它们进行了研究,发现它们原来是睡莲(水百合)等基础被子植物的近亲,这便大大提升了它们的重要性。它们似乎属于一种以前未得到认可的分支,是从接近被子植物根部的地方分出来的一个分支,它是对1999年发现的三个最深的分支的一个根本性的补充,这三个分支曾经重新引发分子生物学家对被子植物起源的兴趣,达尔文曾经将其起源称之为一个“可恶的秘密”。
March 15, 2007
血液的形成与信号作用
在本期Nature上,来自不同研究小组的两篇论文在果蝇的淋巴腺中确定了一个信号作用中心,它控制血液细胞前体的维持。在果蝇淋巴腺的“后信号作用中心”(PSC)中产生的信号,通过JAK/STAT 和 Notch信号作用通道控制先祖细胞和发生分异的血液细胞的平衡。Mandal等人还发现,PSC是被同源基因Antennapedia在胚胎发育早期确定的。Krzemien等人发现,来自PSC的Notch信号作用控制Collier,它是果蝇身上相当于哺乳动物早期B-细胞因子的一个成分。这项工作表明,关于血液形成的果蝇模型体系,有可能是对与自己的生存环境发生相互作用的血液细胞前体进行基因操纵和直接活体成像研究的一个重要工具。
March 15, 2007
组蛋白伴护分子CIA/ASF1的晶体结构
核小体(染色质结构的最小单位,由组蛋白和DNA组成)的结构转换对由DNA调控的反应有关键效应。核小体组装和分解的机制一直难以确定,但是现在,一个与组蛋白H3 和 H4形成复合物的组蛋白伴护分子CIA/ASF1的晶体结构已被确定。该研究显示,这一伴护分子能够破坏组蛋白H3-H4四聚物的结构。
ContentsEditorials
In praise of the 'brain drain' p231
Countries and professions that export skilled staff do not always lose out.
doi:10.1038/446231a
Full Text | PDF (104K)
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The legacy of Linnaeus p231
Taxonomy in an age of transformation.
doi:10.1038/446231b
Full Text | PDF (131K)
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Open for business p232
California's stem-cell institute is already transparent enough.
doi:10.1038/446232a
Full Text | PDF (64K)
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Top of pageResearch Highlights
Research highlights p234
doi:10.1038/446234a
Full Text | PDF (391K)
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Top of pageNews
Geophysicist faces probe into use of research funds p236
Co-founder of European Academy of Sciences comes under scrutiny.
Jim Giles
doi:10.1038/446236a
Full Text | PDF (595K)
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Q&A: Klaus Töpfer p237
Germany's former environment minister analyses Europe's plan for cutting emissions.
doi:10.1038/446237a
Full Text | PDF (398K)
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Special Report
Seed money to bring in pioneers p238
California's stem-cell initiative has finally handed out its first research grants. But will all the money actually move the field forward? Erika Check reports.
doi:10.1038/446238a
Full Text | PDF (451K)
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Microbes reveal extent of biodiversity p240
Ocean trawl yields vast number of unknown proteins.
Heidi Ledford
doi:10.1038/446240a
Full Text | PDF (535K)
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Bush challenged on funding for children's study p240
Congressman rebuffs president's proposed cuts.
Meredith Wadman
doi:10.1038/446240b
Full Text | PDF (535K)
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Sidelines p241
doi:10.1038/446241a
Full Text | PDF (305K)
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Passive-smoking study faces review p242
Did the tobacco industry skew results of survey?
Rex Dalton
doi:10.1038/446242a
Full Text | PDF (151K)
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News in brief p243
doi:10.1038/446243a
Full Text | PDF (212K)
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Correction p243
doi:10.1038/446243b
Full Text | PDF (212K)
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Top of pageColumn
Party of One
Washington, we have a problem p244
Does anybody care about NASA? Most in Congress do only if there is a research centre in their district. David Goldston explains why members never step up to the plate to set priorities.
David Goldston
doi:10.1038/446244a
Full Text | PDF (154K)
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Top of pageBusiness
Quantum leap of faith p245
A Canadian company says it is the first to bring a quantum computer to market but, as Geoff Brumfiel reports, not everyone is buying into the approach.
doi:10.1038/446245a
Full Text | PDF (180K)
See also: Editor's summary
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Top of pageNews Features
Linnaeus at 300: We are family p247
Updating the tree of life needs both the skills of evolutionary biologists and the data from genome-crunchers — the two ignore each other at their peril. John Whitfield reports.
doi:10.1038/446247a
Full Text | PDF (779K)
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Linnaeus at 300: The species and the specious p250
For some, species are simply the things you save; but for taxonomists, the concept is much more complex. Emma Marris asks whether Linnaeus's legacy is cut out for conservation.
doi:10.1038/446250a
Full Text | PDF (732K)
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Linnaeus at 300: The big name hunters p253
Professional taxonomists often bristle at non-professionals who name new species without going through peer review. But are amateur naturalists really bad for science? Brendan Borrell reports.
doi:10.1038/446253a
Full Text | PDF (477K)
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Linnaeus at 300: The royal raccoon from Swedesboro p255
Although Linnaeus is best known for his botany and taxonomy, he was also an anatomist — and a keeper of pets. Henry Nicholls tells the story of Sjupp the raccoon.
doi:10.1038/446255a
Full Text | PDF (325K)
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Top of pageCorrespondence
Publications should include an animal-welfare section p257
Hanno Würbel
doi:10.1038/446257a
Full Text | PDF (84K)
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Scientists need to confront economists about peak oil p257
Michael Lardelli
doi:10.1038/446257b
Full Text | PDF (84K)
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Concept of a bacterium still valid in prokaryote debate p257
Thomas Cavalier-Smith
doi:10.1038/446257c
Full Text | PDF (84K)
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Faulty logic p257
Alex C. W. May
doi:10.1038/446257d
Full Text | PDF (84K)
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Top of pageCommentaries
Linnaeus in the information age p259
As we celebrate the visionary genius of Carl Linnaeus, it is time to analyse how professional taxonomy interfaces with the rest of biology and beyond. Where next for Linnaeus's heirs, asks H. C. J. Godfray?
doi:10.1038/446259a
Full Text | PDF (725K)
See also: Editor's summary
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Spreading the word p261
Keeping track of new species names is a growing challenge for modern taxonomists. Sandra Knapp, Andrew Polaszek and Mark Watson make the case for electronic publication of scientific names.
doi:10.1038/446261a
Full Text | PDF (402K)
See also: Editor's summary
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Top of pageBooks and Arts
Biological programming p263
The digital nature of molecules such as DNA means they can be used in computers.
Christoph Adami reviews Genesis Machines: The New Science of Biocomputing by Martyn Amos
doi:10.1038/446263a
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Mammals on the move p264
Zofia Kielan-Jaworowska reviews The Beginning of the Age of Mammals by Kenneth D. Rose
doi:10.1038/446264a
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