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用结构预测未知酶的功能

作者： 来源：生命经纬 时间： 2007-08-17 字体： [大中小]

如果一种新发现的蛋白与已知的酶相似时，科学家们常常据此来推断未知酶的功能，否则，单从结构—功能关系是非常难以判断未知酶的功能的。

现在，Johannes Hermann等人利用一种变通的分子对接方法（一种用来寻找潜在药物的计算机辅助的模拟方法），设计出一种根据结构来预测某种具有未知活性的酶的功能的方法。试验用的酶是Tm0936，来自极端喜热的Thermotoga maritima。对接实验预测，它将使5-甲硫腺苷（﹡）和S-腺苷甲硫氨酸（﹡﹡）去胺化；这一点已从与反应产物相结合的该蛋白的X-射线晶体结构上得到了证实。这种酶没有与已知的腺苷胺化酶具有明显相似的序列，甚至它所参与的通道也似乎是新颖的。如果这一新方法也适用于其他酶，那么它很可能成为一种有力工具，来确定关键的酶在体内是如何发挥作用的。

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