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董孟秋《科学》文章解析蛋白质组学新技术

作者： 来源：生物通 时间： 2007-08-07 字体： [大中小]

来自美国斯克利普斯研究所（Scripps Research Institute）Salk生物研究院，加州大学圣地亚哥分校的研究人员利用一种蛋白定量分析新方法对长寿命线虫进行了研究，发现了能延长和缩短寿命的蛋白。这对于进一步丰富蛋白定量研究方面来说意义重大。这一研究成果公布在《Science》杂志上。

文章的第一作者是来自斯克利普斯研究所的Andrew Dillin实验室的董孟秋（Meng-Qiu Dong，音译）。

仅仅知道蛋白质的身份并不足以对蛋白质给出最终定论，因为蛋白质的浓度对于实现其在细胞中的功能来说极其重要，一种特殊蛋白质在浓度上的变化就能预示细胞的突变过程。因此，科学家能够对蛋白质的相对和绝对浓度进行测量，是很重要的事情。过去，科学家通常先进行二维(2D)凝较电泳，切断条带，再用质谱方法测量条带中的蛋白质。可是，这种方法不是很理想：既不是非常敏感，也不是非常精确。

蛋白组学中的方法一直在不断提高。基于高度敏感性和精确性的串联质谱方法，不需要凝胶，就可以获得相对和绝对定量的蛋白质结果。同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）和同位素亲和标签（iCAT）是这些新进展中的两大主力，这些技术具有较好的定量效果、较高的重复性，并可对多达四种不同样本同时进行定量分析。但是仍然存在不尽如人意的地方，需要不断改进。

在这篇文章中，研究人员利用一种蛋白定量分析新方法对长寿命线虫进行了研究，发现了能延长和缩短寿命的蛋白。这种新方法即质谱仪分析方法，他们利用质谱仪比较了带有daf-2突变的线虫和不带突变的线虫的蛋白质的量。识别出47个蛋白质在突变线虫中更丰富，另有39个蛋白质在突变线虫中的量不丰富。实验显示，有些蛋白质增加寿命、有些降低寿命。Stuart K. Kim在一篇相关的研究评述中写道：研究人员将继续改进这个方法，因为这个技术现在只能用来研究线虫基因组中不到10%的蛋白质。

以前科学家也曾了解带有daf-2基因突变的美丽线虫比没有突变的线虫的寿命长一倍。daf-2降低一个名为“类胰岛素信号发生”过程的活性，从而延长了寿命。

（生物通：万纹）

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