电泳迁移实验 EMSA【中国医学科学院】
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电泳迁移实验 EMSA【中国医学科学院】

点击:   作者:51protocol收集   来源:  时间: 2007-03-28  本站论坛

1、核蛋白的提取

①用 细 胞 刮子刮取RAW264.7细胞与VSMC,移入2.5mlEP 管中。②将细胞用冰冷PBS洗两遍,于4, 5000g离心3min,沉淀细胞。③加5倍细胞体积的冰浴缓冲液A洗细胞一次,于4,5000g离心3 min沉淀细胞.④加3倍细胞体积的冰浴缓冲液A悬浮细胞,冰上放置30 min、剧烈振荡10次,4,5000g离心15min,去上清,沉淀为细胞核。⑤加与细胞等体积的冰浴缓冲液B,充分混匀,冰上放置30m in后,于40 ,15 000g离心15min,上清为核蛋白。⑥取2ul核蛋白Bradford法测定核蛋白浓度,分装后于-70保存。

2.探针的标记与纯化

A、 探 针 的标记:将以下试剂加入冰浴中的0.5m lEP管中,总体积20时。①未标记的探针:2ul (50ng); 10 x激酶缓冲液:2g1; [y-32P]ATP: 4ul (40 uCi); T4多聚核甘酸激酶:lul (10U);⑤超纯水:11ul

B.混匀后37水浴30分钟;

C、加入5u1 1%SDS/100 mM EDTA短暂涡旋混匀,以终止激酶反应;

3、探针的纯化

①准 备 MicroSpin' G25分离柱;②轻轻涡旋分离柱以重悬管内树脂;③将盖子拧松1/4后去掉管底密封;④将分离管放入一只1.5mlEP管中(EP管作支撑用) 735g离心l分钟;⑥加入样品:⑦分离管放入一只新的1.5 mlEP管中,缓慢将样品加入树脂床角度平面的中央,735g离心1分钟;⑧将75ul超纯水加入分离柱,735g离心1分钟;⑨收集支撑管内纯化好的探针,小心丢弃分离管。

4,测定探针的放射活性

1ul纯化的探针,用闪烁计数器测量其放射活性,放射活性大于1* 10 5cpm/ul示标记成功。

5,凝胶迁移阻滞法测定NF-KB

A、 按下 列 顺序分别将各反应成分加入第一套做好标记的EP管内:①结合缓冲液:4ul ②稳定液D: 2 ul;③核提取物:lug;④去离子水至:16ul.

B、用移液枪轻轻吸打混匀,4 0C下将核提取物预孵育20分钟,

C、在核提取物预孵育期间,按下列顺序依次将各成分加入做好标记的第二套EP管内:①结合缓冲液:2ul;②稳定液D:1ul;③探针:lul;④去离子水:4ul

D、将探针棍合物加入预孵育好的核提取物混合物中,用移液器轻轻吸打混匀后,4继续孵育20分钟。

E,EMSA测定:预先将5%非变性丙烯酞胺胶(38:2 )电泳缓冲液(1X TGE)预冷至4,然后:①将每反应管内所有反应物加入样品孔中。同时在一空白孔中加入含溟酚蓝的上样缓冲液,以观测胶的移动情况。当溟酚蓝电泳至玻璃板下1/3即可停止电泳(2小时)。②电泳:12.5V/cm(16cm玻璃板为200V)a

F、放射自显影:电泳完毕后,取出凝胶,用保鲜膜封好;将凝胶与放入有增感屏的曝光盒中,于一70 放射自显影24小时。然后将X光片在显影液中显影30sec-1min,在定影中定影15-30min,清水冲洗干净后自然晾干。

G、图像分析:将各测量组的电泳照片扫描至计算机,然后应用Bandscan分析软件对电泳条带进行灰度测定,并计算平均光密度值(OD),以各条带的OD值表示相应核转录因子的活性


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