小鼠肝基因组DNA制备
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  • 小鼠肝基因组DNA制备

  • 点击:    作者:   来源:福建医科大学 日期:2007-12-06    本站论坛
[原理]

    DNA以核蛋白形式存在于细胞核中,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。蛋白酶K及链霉蛋白酶E的应用使这两个原则得到了保证。

    蛋白酶K或链霉蛋白酶E均为广谱蛋白酶,其重要特性是能在SDSEDTA存在下保持很高的活性。在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可破坏细咆膜、核膜,并使组织蛋白与 DNA分子分离,EDTA抑制细胞中DNase活性,蛋白酶K或链霉蛋白酶E将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。再用酚、酚/氯仿抽提除去蛋白质,接着用氯仿抽提以除去DNA溶液中微量酚的污染。最后用无水乙醇沉淀DNA。为获得高纯度DNA,操作过程中常加入RNase除去RNA。获得高分子量DNA的关键是防止DNase降解DNA。故标本必须新鲜,在提取前细胞就保持完整,核、溶酶体等细胞器应没有明显破坏,提取DNA用的离心管等器皿及试剂应消毒。操作在4℃以下进行。

 [操作]

    1.组织DNA的提取  

    1)取小鼠新鲜肝组织,去除结缔组织,用剪刀剪成细小碎块

    2)10倍体积TE缓冲液,用玻璃匀浆器在冰浴中中速匀浆

    3)将匀浆液转入10ml离心管以4000rpm离心10分钟,弃上清

    4)10倍体积TE洗一遍,以4000rpm离心10分钟,弃上清

    5)加适量TE稀释

    6)400µl稀释液于1.5mlEppendorf管,缓慢加入10SDS溶液,至终浓度0.5  (20µ1),摇匀直至溶液变粘稠

    7)加入Rnase(200µgm1)至终浓度20ugm1(42µl)混匀,置37℃保温60分钟总体积  (420µ1)

    8)加蛋白酶K(20mgm1)至终浓度100ugm1混匀(21u1),于50℃保温3小时,并间歇搅动(总体积441µ1)

    9)将此溶液冷却至室温,加等体积饱和酚抽提,以10000rpm离心10分钟。

    10)取上清加12体积饱和酚,12体积氯仿/异戊醇抽提一次,以10000rpm离心10分钟

    11)取上清,加等体积氯仿/异戊醇抽提一次,以10000rpm离心10分钟

    12)110体积5MKAc,加2倍体积无水乙醇充分混匀,以12000rpm离心10分钟

    13)lml70%乙醇洗沉淀,以12000rpm离心10分钟

    14)待酒精挥发尽后加20ul TE溶解,4℃储存

    2.电泳鉴定

    DNA样品2µ1加上样缓冲液10µ1 (含溴酚蓝指示剂和甘油),在0.8%琼脂糖凝胶进行水平微型电泳,电压<5Vcm,时间2小时左右。电泳后取出凝胶,用0.5µgml的溴化乙锭染色20分钟,用紫外灯观察分析。

[试剂及器材]

    1.试剂

    蛋白酶K:称取20mg蛋白酶K溶于lml消毒双蒸水中,-20℃备用。

    RNase(牛胰):称取10mgRNase溶于lml下列混合液中:10mmoll Tris-HClpH8.0 lmmolL EDTANa2pH8.050%甘油。

    10SDS溶液:称取10gSDS溶于100ml消毒双蒸水中,于65℃保温2小时,贮存室温备用。

    1×TE缓冲液(pH8.0)10mmolL Tris-HClpH8.0lmmolLEDTANa2pH8.0。配制后高压灭菌,4℃贮存。

    1×TE饱和重蒸酚(pH8.0)

    氯仿/异戊醇(24:1VV)

    10molLNH4AC,配制后高压灭菌,4℃贮存

    无水乙醇(AR)

    70%乙醇

    2.器材

    玻璃匀浆器;离心机;电泳仪;电泳槽;紫外透射反射分析仪。


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